扣除標準仍未統一
目前，內外資企業執行的是兩種不同的稅前扣除標準。如在工資扣除方面，內資企業只能按照800元的計稅工資標準列支，個別地區可以上浮20%，而外資企業則按照實際工資列支。對于公益性、救濟性捐贈支出、業務招待費、利息費用支出、呆賬和壞賬準備金提取等方面，對內外資企業的扣除規定也都不同。這造成了內資企業要比外資企業支付更多的所得稅。
在目前討論的草案中，內資企業計稅工資據實扣除的目標未能實現，而是參照了個人所得稅的1600元扣除標準，將內資企業的工資稅前列支扣除標準也提高到了1600元。
楊崇春建議，新的法律除了計稅工資應據實扣除，還應該為企業的職工福利、教育經費、工會會費、廣告費、研發費用等，制定一個統一比例的扣除標準。“還應該提高捐贈的扣除比例，鼓勵企業支持公益和救濟事業�！睏畛绱赫f。
此外，對于環保、安全生產等方面的資產投資，應制定專門的稅收抵免規定；對固定資產、無形資產、待攤費用、對外投資和存貨等資產處理方面，也應該有統一規定。
稅率考量
關于最被重視的稅率問題，一位專家向記者透露，在討論草案時，盡管專家們基本都傾向于24%~27%之間，但這個稅率卻一再變化，很難確定。“盡管只是一兩個百分點的差別，對企業的影響卻將非常大�！边@位專家表示，新的企業所得稅法中，稅率一旦確定，將是一個“一刀切”的數字，中小企業將不被照顧。
盡管現行的法定企業所得稅稅率為33%，但對內資企業中的微利企業分別實行了27%和18%的優惠稅率，對外資企業則實行24%和15%的稅率。2004年的數據顯示,企業所得稅稅負約為23%，其中內資企業為25%左右，外資企業約為15%。
“我傾向于25%左右�！睏畛绱罕硎�，這個稅率有利于個人所得稅和法人繳納的所得稅相銜接。他同時表示，應該對中小企業再定一檔低稅率予以照顧，“建議對年利潤在10萬元以下的企業，按18%來征收。”
過渡期
對于過渡期，討論的草案中仍然延續了“獲利年度”的概念。據專家透露，討論中曾提出了“免二減三”和對基礎行業企業實行“免五減五”的辦法�！懊舛䴗p三”即從外資企業盈利年度起，第一年和第二年免征企業所得稅，第三年至第五年減半征收企業所得稅；對基礎行業，則是5年免征，5年減半。
楊崇春建議，將稅收優惠過渡期定為5年，將“獲利年度”改為“經營銷售年度”。
楊崇春還建議，應借此機會明確國稅局和地稅局征收企業所得稅的范圍，征收增值稅和消費稅為主的企業由國稅局征收所得稅，征收營業稅為主的企業則由地稅局征收所得稅，并取消涉外征管機構，全面整合稅務機構。
“‘兩法合并’還有很多工作要做。即使沒有如期一審，我也并不失望，因為我發現‘兩法合并’已經被越來越多的人接受并認可，是大勢所趨。”楊崇春表示，即使無法做到全面系統地一步到位，還可以在推出新法后，以條例、細則和解釋說明等方式，再完善有關規定。(陳黛)
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