中新網10月15日電 事件后，臺灣當局“行政院長”游錫堃聲稱他對印尼巴厘島連串爆炸案事先知情。此言引致國民黨和親民黨兩黨“立院”黨團的相繼指責。臺灣當局“行政院”發言人莊碩漢昨天辯解說，各國家和地區接到這類訊息通常都不事先預警，而且臺當局“行政院”此次沒有提出警訊也是應美國方面的要求，但“因應措施均已備妥”。

　　莊碩漢聲稱，對此類訊息通常不作事先預警，是為避免引起不必要恐慌與不安。

　　據臺灣媒體報道，臺當局高層聲稱上周五已掌握印尼爆炸案訊息，實為美國駐臺機構(AIT)提供給臺當局“國安局”的資料，該密函明確指出，以本·拉登為首的“基地”恐怖組織，已鎖定美國海外據點發動攻擊，其中印尼、沙特阿拉伯為最可能的地點。AIT并要求臺灣當局對此訊息“高度保密”。

　　但有國民黨和親民黨“立委”就此指臺當局根本沒盡到保護人民的責任，并呼吁將巴厘島列為“高危險地區”。