盡管國際奧委會與國際反興奮劑機構先后原諒了菲爾普斯吸食大麻的行為，但更大的麻煩卻困擾著菲爾普斯。由于菲爾普斯吸毒所在的美國南卡羅萊納州法律規定吸毒違法，當地警方正在考慮對這位“美國傳奇英雄”進行刑事罪名指控，菲爾普斯將面臨30天監禁的牢獄之災。

　　菲爾普斯是在美國南卡羅萊納州的里奇蘭縣境內吸食大麻的，按照該州的法律，擁有1盎司(大約相當于28.35克)或更少的大麻是一種輕度犯罪，初犯者將被處以200美元罰款和30天的監禁。

　　在《世界新聞報》報道了菲爾普斯是在南卡羅萊納州大學的聚會上吸毒后，這位美國英雄立即進入了南卡羅萊納州警方的視野。值得一提的是，菲爾普斯這次撞到了“槍口”上，因為他吸毒所在的里奇蘭縣警方首長萊昂·洛特，正是以對毒品的強硬態度而聞名。萊昂·洛特本人在接受美聯社的采訪時明確表示，如果查明菲爾普斯的確是在里奇蘭縣轄區內吸食大麻，該縣警方將肯定會追究到底。他說：“這個案子跟其他沒有什么不同，情況甚至還更加清晰，我們現在已經擁有某人在吸食毒品的照片，而他本人也已經承認，我們只要查明這件事在何處發生就可以了。”

　　負責菲爾普斯案件的南卡羅萊納州官員克里斯·科文則向美國媒體透露，地方治安官的調查還需要收集更多的照片，作為指控菲爾普斯使用玻璃器皿吸食大麻而違反相關法律的證據，“我們的麻醉品部門正在整理我們掌握的信息，他們也正在討論將以何種名義提出起訴。”不過，科文拒絕透露調查的詳細情況。“我們的底線是，只要他違反了法律，只要他是在里奇蘭縣犯法，他就將被指控。菲爾普斯和每天因同樣劣跡作奸犯科而被法辦的人一樣，不會有區別對待。”

　　雖然菲爾普斯承認吸毒，但是，他吸毒所在的私人聚會地點并不明確，南卡羅萊納州大學已經告訴警方，目前沒有證據說明菲爾普斯是在校園內吸毒的，因此，現在警方調查取證的關鍵在于菲爾普斯究竟是在何處吸食大麻，如果警方得到有力的證據，菲爾普斯將難逃法律制裁，并將面臨最少30天的監獄生活，這恐怕是菲爾普斯最不愿意看到的。截至目前，菲爾普斯和他的經紀團隊尚未就警方的強硬態度有所回應。